L'équipe BioSol

Karine LAVAL
Dr Karine LAVAL, HDR @
Microbiologie

Ecologie Microbienne
Biologie Moléculaire

Marc LEGRAS
Dr Marc LEGRAS @
Chimie

Chimie de l'Environnement
Biogéochimie - Physico-chimie des sols

Site Web Personnel
Isabelle TRINSOUTROT-GATTIN
Dr Isabelle TRINSOUTROT-GATTIN @
Responsable du laboratoire
Ecologie Microbienne

Caractérisation de la matière organique
Biotransformations du carbone
et de l'azote dans les sols

Christophe GANGNEUX
Dr Christophe GANGNEUX @
Biologie Cellulaire et Moléculaire

Biologie Moléculaire
Nadia LAURENT
Dr Nadia LAURENT @
Biologie et Agronomie

Ecologie Microbienne
Pierre-Yves BERNARD
Pierre-Yves BERNARD @
ING AGRO

Agronomie
Caroline BAILLEUL
Caroline BAILLEUL @
Chimie Analytique - Biochimie
Lisa CASTEL
Lisa CASTEL @
Ecologie microbienne
Magali MANIEZ
Magali MANIEZ @
Enseignements
Laurence ALAIN
Laurence ALAIN @
Assistante
Début

Post-docs, Doctorants, Stagiaires

Jean TRAP
Jean TRAP @
Post-Doc
Doctorat Ecologie

Ecologie microbienne
Benoit RICHARD
Benoit RICHARD @
Bourse Région HN
Master Recherche Ecologie, Evolution, Biométrie

Thèse de Doctorat: Règles d'assemblage des communautés d'oligochètes terrestres. (MLG)
Marc-Antoine CANNESAN
Marc-Antoine CANNESAN @
Bourse Région HN
Master Recherche Biologie Cellulaire et moléculaire - Université de Rouen

Thèse de Doctorat: Protection des cultures d'intêret économique: Caractérisation des relations plantes-microorganismes-sol. (CG)
Wassila RIAH
Wassila RIAH @
Master Microbiologie - Université de Rouen

comment les modes d’occupation et la présence de composés organiques (HAP) déterminent les profils d’expression des fonctions de sols agricoles (IG)
Laétitia MESLEM
Laétitia MESLEM @
CDD
Master - Université de Rouen

Bioindicateurs de la qualité biologique des sols
 Audrey COURANT
Audrey COURANT @
Licence Pro Chimie de l'Environnement - Université de Rouen - 2011

Extraction d'éléments traces dans les sédiments. Quantification de la biomasse fongique dans les sols. (MLG)
 Christelle LEFEVRE
Christelle LEFEVRE @
Master Microbiologie - Université de Rouen - 2011

Activités biologiques et fonctionnement du sol. Analyses des profils protéiques et diversité métabolique potentielle de bactéries thermiques dans différents sols agricoles (NL)
 Marie VOILLEQUIN
Marie VOILLEQUIN @
Master 1 Biologie santé - biologie cellulaire - Université de Rouen - 2011

Impact des hydrocarbures aromatiques polycliques sur l’activité fonctionnelle des bactéries telluriques (NL)
Youcef ATIA
Youcef ATIA @
Master Bio Santé Biologie Cellulaire - Université de Rouen - 2011

Développement d’un test prédictif de la pourriture racinaire du pois causée par aphanomyces euteiches. (CG)
 Aboubecrine TOURE
Aboubecrine TOURE @
Master 2 Espace Rural et Environnement - Université de Bourgogne - 2011

Les relations entre la présence organique et les profils d’expression des activités enzymatiques dans les sols (IG)
Début

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Laetitia FARCY
Laétitia FARCY @
Master 2 "Procédés pour la Qualité de l'Environnement" - Université de Marne-La-Vallée - 2010

Etude de sites pollués et de l’impact des polluants sur la qualité de la biomasse des sols. Quantification de la biomasse fongique par extraction de marqueurs (ergostérol et/ou PLFA spécifiques) par SPE et approches chromatographiques. (MLG)
Claire BENNETEU-SAILLANT
Claire BENNETEU-SAILLANT @
Licence pro "Contrôle agroalimentaire et biotechnologique" - Université de Rouen - 2010

Impact des HAP sur l'activité métabolique potentielle des bactéries telluriques: étude préliminaire en microcosmes avec pollution contrôlée (NL)
Pierre PLASSART
Pierre PLASSART @
Bourse Région HN
Master Recherche Biologie Cellulaire

Thèse de Doctorat: étude de l’impact du mode d’occupation des sols sur les communautés bactériennes et les populations de Pseudomonas telluriques. (KL)
Fazia TAHRAOUI
Fazia TAHRAOUI @
Master Sciences pharmaceutiques et Biologiques - Université de Lille - 2010

Etude de la diversité fonctionnelle des bactéries telluriques sous différentes conditions anthropiques au sud de la France (NL)
Adélaïde BRUYER
Adélaïde BRUYER @
Master Recherche Ecologie microbienne - Université de Lyon - 2009/2010

Doctorat: Protection des cultures d'intêret économique: Caractérisation des relations plantes-microorganismes-sol . (MLG)
Christelle LEFEVRE
Christelle LEFEVRE @
Master 1 Microbiologie - Université de Rouen - 2010

Comment les modes d’occupation et la présence de composés organiques (HAP) déterminent les profils d’expression des fonctions de sols agricoles ? (IG)
Loïc FLOUREZ
Loïc FLOUREZ@
BTS Bioanalyses et Contrôles

Lycée Galilée - 2009/2010

Mise au point de l'extraction phase solide pour la quantification des PLFAs dans les sols (CB)
Ismahéne TOUATI
Ismahéne TOUATI @
Master 1 Biologie, santé-Parcours microbiologie - Université de Caen - 2010

Les mesures d’impact de stress environnementaux sur l’abondance et la diversité des communautés fongiques des sols. (CG)
Jérémie LEBRUN
Jérémie LEBRUN @
Bourse INRA et Région HN
Laboratoire BioSol / Unité PESSAC INRA Versailles

Thèse de Doctorat: Impact écotoxicologique de polluants sur la diversité fonctionnelle des communautés fongiques des sols cultivés. (IG)
Alexandra EUDIER
Alexandra EUDIER@
BTS Bioanalyses et Contrôles

Lycée Galilée - 2009

Etudes des activités enzymatiques exprimées in situ dans des sols (IG)
Alisson-Fleur HONNIBALL
Alisson-Fleur HONNIBALL @
Licence Chimie

Université de Rouen - 2009

Etude de sites pollués et de l’impact des polluants sur la qualité biologique des sols. Quantification de la biomasse fongique via marqueurs moléculaires (MLG)
Jaime Arturo GARCIA
Jaime Arturo GARCIA Ochoa @
Master 2 Pro - Sols et Dechets - Ecotechnologies et Procédés Propres
Université Paul CEZANNE, Aix-Marseille III - 2009

Etudes des activités enzymatiques exprimées in situ dans des sols sous différentes contraintes anthropiques (travail du sol et polluants) au nord de la France. (IG)
Mustapha HAMMA
Mustapha HAMMA @
Master Pro Chimie "Valorisation des coproduits issus de la production agricole et forestière"

Université de Limoges - 2009

Etude de sites pollués et de l’impact des polluants sur la qualité biologique des sols. Quantification de la biomasse fongique via marqueurs moléculaires (MLG)
Charlemagne OGNIN
Charlemagne OGNIN @
Master 1 "Environnement Sols Eaux et Biodiversité"

Université de Rouen - 2009

Diversité fonctionnelle potentielle en sols contaminés (NL)
Elise MELLOUL
Elise MELLOUL @
Stage volontaire -

Université de Rouen - 2009

Etude moléculaire et microscopique de l’infection du lin fibre (Linum usitatissimum) par Verticillium dahliae (CG)
Laura FOURNEAUX
Laura FOURNEAUX
Collège Jean de la Varende - 2008
Stage découverte (CB/MLG)
Sylvie DESAIRE
Sylvie DESAIRE @
Ingénieur d'études - 1998-2008

Microbiologie - Biologie Moléculaire
Adeline JANNOT
Adeline JANNOT @
Licence Environnement
Université de Rouen - 2008

Les marqueurs chimiques de la biomasse sont-ils pertinents ?

Hélène SAUVAGE
Hélène SAUVAGE @
Bourse CIFRE / ATER
Laboratoire BioSol / Université de Rouen - 2003-2007

Thèse de Doctorat: Distribution spatiale de l'inoculum d'aphanomyces euteiches dans les parcelles de pois protéagineux

Aurélie HUBERT
Aurélie HUBERT @
Docteur en biochimie et biologie cellulaire - 2006

Caractérisation de la diversité fonctionnelle tellurique: Mise au point méthodologique pour l'analyse du compartiment biologique
Joel NZAMBA
Joel NZAMBA @
Master 2 Evaluation des risques environnementaux
Université du Havre - 2007

L'analyse de l'impact de polluants sur les activités enzymatiques dans les sols agricoles.
Pierre CHEVREAU
Pierre CHEVREAU @
Master Biologie des populations et des Ecosystèmes
Université de Rouen - 2007

Etude de l’impact du cuivre sur la biomasse fongique dans les sols agricoles.
Boniface HARELIMANA
Boniface HARELIMANA
Master Pro Biologie fondamentale et appliquée
Université du Havre - 2006

Impact des polluants sur la communauté bactérienne dans les sols de prairies et de grandes cultures
Laure DECHAUX
Laure DECHAUX @
Stage de fin d'études
Ecole Nationale Supérieure de Chimie Montpellier - ENSCM - 2006

Etude de l’impact de polluants sur la biomasse fongique dans les sols de prairies et de grandes cultures
Nadine TADJA NYA
Nadine TADJA NYA
Master 1 Biologie cellulaire et physiologie - Bioinformatique
Université de Rouen - 2006

Développement d’une méthode de quantification de groupes fongiques, telluriques par analyse de bases de données phylogéniques de séquences d’ADN ribosomaux et PCR quantitative
Louise COMMARE
Louise COMMARE
Master Pro Biologie fondamentale et appliquée
Université du Havre - 2006

Caractérisation de matières organiques exogènes valorisées en agriculture
Samia TIRECHE
Samia TIRECHE
Master 1 Biologie
Université de Rouen - 2006

Impact de polluants sur la communauté bactérienne dans les sols de prairies et de grandes cultures. Quantification des bactéries telluriques par cytométrie en flux
Sophie DUVIALARD
Sophie DUVIALARD @
Licence de Chimie
Université de Rouen - 2006

Quantification de la biomasse fongique par extraction des PLFA du sol
Raphaël CALBRIX
Raphaël CALBRIX @
Bourse ACTA-ADEME
Laboratoire BioSol / Université de Rouen 2001-2005

Thèse de Doctorat: Adaptation des micro-organismes du sol aux changements environnementaux liés aux pratiques culturales, étude de la biodiversité génétique et fonctionnelle.
Simina CONSTANTINESCU
Simina CONSTANTINESCU @
Bourse SOCRATES - ERASMUS
Université Roumaine "Dunàrea de Jos" - Galati
Faculté d'Ingénierie - Bràila

Esitpa - Projet de recherche et développement - 2006

Développement d'une méthode permettant l'analyse de profils protéiques à partir d'échantillons de sols.

Amine ATEK
Amine ATEK
Master 1 Biologie et application – option Biochimie – Microbiologie
Université de Rouen - 2005

Analyse des profils protéiques du sol et mesures d'activités enzymatiques

Odile LUCAS
Odile LUCAS
Master Pro Génétique, Physiologie, Biotechnologie
Université de Limoges - 2005

Mise au point de la quantification des bactéries telluriques par cytométrie en flux et PCR en temps réel

Tawfik FAJRI
Tawfik FAJRI
Master Pro Sciences de la Vie et de la Santé, Mention Biologie et Santé : Spécialité Biotechnologie
Université de Bordeaux II - 2005

Développement et validation d'une méthode de quantification des communautés bactériennes et fongiques des sols par PCR en temps réel

Maud MAZE
Maud MAZE
Master Pro Analyses, contrôle et expertise dans l’agrochimie et les Bioindustries
Université de Rouen - 2005

Détermination de la biomasse fongique par quantification HPLC de l'ergostérol

Farida LAADANI
Farida LAADANI
Licence IUP Chimie analytique et démarche qualité
Université de Poitiers - 2005

Mise au point de la quantification d'un FAME spécifique de la biomasse fongique par CPG

Audrey FACON
Audrey FACON
Master Ecocaen Biologie Fondamentale et Appliquée - Gestion et valorisation agri-environnementale
Université de Caen - 2005

Estimiation de la qualité des sols agricoles par quantification des microorganismes telluriques par PCRq en temps réel - Etablissements des valeurs seuils

Gaetan MONNIER
Gaetan MONNIER
Master Pro Biologie
Université du Havre - 2005

Mise au point méthodologique et évaluation d’un protocole d’électrophorèse bidimensionnelle des protéines du sol

Camille DERAEVE
Camille DERAEVE
SIR 4ème Année
Esitpa - Ecole d'Ingénieurs en Agriculture - 2005

Effect de l'implantation à long terme de cultures intermédiaires pièges à nitrates sur l'activité biologique des sols et la qualité de la matière organique
Sorin MUNTEAN
Sorin MUNTEAN
En Association avec le Laboratoire LAMSAD - Esitpa - 2004
Bourse régionale Post-doc étranger
Docteur en Phytotechnie - Roumanie - Université Cluj-Napoca

Post-Doc: Modelisation non paramétrique du transfert des métaux lourds dans les graines de lin oléagineux
Quentin BURY
Quentin BURY
DESS Valorisation Chimique et Biologique des Productions Agricoles
Université de Limoges - 2004

CDD: Transfert des éléments traces dans les graines de lin oléagineux
Soisic QUIMERC'H
Soisic QUIMERC'H
4ème Année Esitpa - SIR - 2004

Etude de la diversité fongique et bactérienne dans des parcelles infestées par Aphanomyces euteiches
Pierre PLASSART
Pierre PLASSART
Maitrise de Bio. Cell. & Physio. Végétale
Université de Rouen - 2003/2004

Etude de la diversité des communautés microbiennes telluriques dans les différents systèmes agraires contrastés - CDD - Microbiologie, Biochimie
Mélanie TOUTAIN
Mélanie TOUTAIN
DESS "Maitrise de la biologie des populations et des écosystèmes" - Université du Havre - 2004

Mise au point d'une méthode moléculaire d'établissement des ratios bactries/champignons dans les sols agricoles
Nicolas RICHARD
Nicolas RICHARD
4ème Année Esitpa - SIR - 2004

Clonage d'un fragment d'ADN génomique Aphanomyces euteiches dans le but d'établir un étalon de quantification par PCR
Céline DUQUE
Céline DUQUE
4ème Année Esitpa - SIR - 2004

Corrélation quantité d'ADN Aphanomyces euteiches et potentielle infectieux
Karima CHEKOUR
Karima CHEKOUR
Maitrise de Biologie des Populations et Ecosystèmes - Université de Rouen - 2004

La biomasse fongique dans les sols. Techniques d'extraction et quantification de l'ergostérol par HPLC
Elena BARRENA MARQUES
Elena MARQUES BARRENA
Université de Pamplune - Espagne - 2003/2004

Mise au point de la quantification par PCR en temps réel des communautés fongiques du sols dans le cas de systèmes agraires contrastés
Samuel SARCIAUX
Samuel SARCIAUX
4ème Année Esitpa - SIR - 2004

Diversité microbienne des sols et qualité des matières organiques
Sophie MAYER
Sophie MAYER
4ème Année Esitpa - SIR - 2003

Mise au point de la quantification par PCR en temps réel de micro-organismes phyto-pathogènes de la pomme de terre
Cecile LAROCHE
Cecile LAROCHE
Technicienne - 2003

CDD - Genie Biologique
Nathalie COLLIN
Nathalie COLLIN @
Secrétariat - 2003
Cécile ROLLET
Cécile ROLLET
MST Lyon - 2003

Diversité microbienne des sols et qualité des matières organiques
Bertrand BOUTROUX
Bertrand BOUTROUX
DESS Analyse Agro-alimentaires - 2003

Spéciation des métaux lourds dans les sols en vue de la détermination de leur disponibilité pour les plantes. Application au lin oléagineux
Jimena RIPA MIQUELEZ
Jimena RIPA MIQUELEZ
5ème Année ISARA - 2003

Analyse de la répercussion de différents épandages sur la diversité des communautés microbiennes telluriques
Hasna ESSANAOUBAR
Hasna ESSANAOUBAR
Maitrise de Biochimie - 2003

Localisation par microscopie des microorganismes et cellules végétales dans les sols: mise au point méthodologiques
Audrey PETIT
Audrey PETIT
BTS Biochimie - Lycée FStP - 2003

Mise au point du dosage de l'ergostérol extrait de sols agricoles par HPLC
Hélène ROVIRA
Hélène ROVIRA
Maitrise de Biochimie - U Rouen - 2003

Validation de la méthode de quantification de l'ADN total extrait du sol comme estimateur de la biomasse microbienne tellurique
Benoit MARTINET
Benoit MARTINET
Maitrise de Biologie des Populations et Ecosystèmes - U Rouen - 2003

Etude de la biomasse fongique dans différents types de sol. Extraction et analyse HPLC de l'ergostérol
Florence TRUYENS
Florence TRUYENS
Maitrise Biologie des populations et des écosystèmes - U Rouen - 2003

Diversité microbienne des sols et qualité des matières organiques
Amélie MAERTENS
Amélie MAERTENS
DUT Biochimie - U Rouen - 2003

Mise au point du dosage des sucres par chromatographie liquide
Christophe VATTEMENT
Christophe VATTEMENT
Maîtrise U Rouen - 2002

Etude des communautés bactériennes telluriques par l'outil moléculaire.
Emilie AUBERT
Emilie AUBERT
Maîtrise Université Rouen - 2002

Etude des communautés microbiennes des sols dans des systèmes agraires contrastés.
Fatima KHARBOUCH
Fatima KHARBOUCH
Maîtrise Université Rouen - 2002

Spéciation des métaux lourds dans les sols et végétaux.
Sylwia Zebrowska
Sylvia Zebrowska
5ème année ESITPA - 2001

Stage Fin d'Etude: Variabilité spatiale de la biodiversité d'un sol de prairie: mise en relation avec la diversité floristique du compartiment épigé.
John Place
John Place
Maîtrise Université de Rouen - 2001

Etude de la diversité microbienne des sols en fonction des systèmes agraires.
Matthieu Watteau
Matthieu Watteau
Maîtrise Université de Rouen - 2001

Caractérisation pédologique et cartographique des sols des zones humides de la vallée de la Seine.
Pascale PUGET
Pascale PUGET
Docteur en Sciences de l'Environnement - 1999-2001

Stock et dynamique des matières organiques des sols.
Jean-Marc LLORENS
Jean-Marc LLORENS @
Docteur en Physiologie Végétale - 1998-2006

Fertilité chimique des sols et nutrition des plantes
Pierre PETRIOL
Pierre PETRIOL
DUT Université de Rouen - 2001

Dosage d'Eléments trace en spectroscopie d'absorption atomique - Application aux sols agricoles de la plaine de Caen.
Début

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Révision : 8 mars 2011.
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